Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMBRP28336 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMBRP28336 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms