Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1BP28222 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms