Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HLA-DMAP28067 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms