Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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