Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GPD1P21695 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD1P21695 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD1P21695 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GPD1P21695 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPD1P21695 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPD1P21695 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms