Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CCNA2P20248 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCNA2P20248 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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