Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM21P19474 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms