Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SPI1P17947 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPI1P17947 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPI1P17947 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms