Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTPS1P17812 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTPS1P17812 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms