Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RALAP11233 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RALAP11233 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RALAP11233 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RALAP11233 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RALAP11233 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RALAP11233 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RALAP11233 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RALAP11233 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RALAP11233 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RALAP11233 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RALAP11233 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RALAP11233 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RALAP11233 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RALAP11233 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RALAP11233 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms