Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HLA-DQB1P01920 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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