Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1AO95602 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLR1AO95602 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms