Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPBO95292 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPBO95292 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPBO95292 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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