Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OFD1O75665 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OFD1O75665 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OFD1O75665 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OFD1O75665 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OFD1O75665 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
OFD1O75665 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OFD1O75665 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OFD1O75665 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms