Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC22BO75396 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms