Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F3O00716 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms