Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E9PBE3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E9PBE3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E9PBE3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E9PBE3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms