Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GGTLC3B5MD39 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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GGTLC3B5MD39 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GGTLC3B5MD39 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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