Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SOBPA7XYQ1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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