Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLHL33A6NCF5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms