Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
UBA6A0AVT1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms