Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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