Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PIAS3Q9Y6X2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms