Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD54BQ9Y620 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms