Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ATG4BQ9Y4P1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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