Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms