Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX6Q9UNH7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms