Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms