Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTNNAL1Q9UBT7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms