Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DKK3Q9UBP4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DKK3Q9UBP4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms