Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COMMD8Q9NX08 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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