Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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