Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHACTR1Q9C0D0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms