Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM55Q9BYV6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms