Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM5DQ9BY66 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms