Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC46A2Q9BY10 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms