Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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