Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMCHL2Q9BQD1 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms