Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C19orf43Q9BQ61 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms