Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms