Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms