Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RBBP8Q99708 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms