Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms