Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELF4Q99607 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms