Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NUP88Q99567 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms