Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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