Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HDAC11Q96DB2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC11Q96DB2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms