Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NXNL1Q96CM4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms