Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDPD1Q8N9F7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms