Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms